Estas grutas se caracterizan por sus cascadas de carbonato de calcio, sus enormes cortinas petrificadas, sus formaciones excéntricas de estalactitas, estalagmitas, estalagmatos o columnas. La piedra caliza ayuda a que la filtración del agua sea más fluida, ayudando a la formación de las estalactitas, pero, aún así, tarda aproximadamente 100 años en que se forme de 1 a 2 cm. Ha sido habitada durante varias épocas de la historia, esto se puede asegurar gracias a las investigaciones realizadas y a los vestigios mayas hallados en ella, como vasijas rotas con pinturas rupestres, metates e indicios de fogata.